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基于通路和網(wǎng)絡(luò)方法對(duì)重度抑郁癥和阿爾茨海默癥易感基因的分析
關(guān)鍵詞：重度抑郁癥 阿爾茨海默癥 通路富集分析 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò) 風(fēng)險(xiǎn)基因
摘要：目的運(yùn)用通路富集和網(wǎng)絡(luò)分析的方法揭示重度抑郁癥(major depressive disorder,MDD)和阿爾茨海默癥(Alzheimer’s disease,AD)的共病生物過程和異常通路,預(yù)測(cè)潛在風(fēng)險(xiǎn)基因。方法對(duì)MDD或AD易感基因進(jìn)行通路和網(wǎng)絡(luò)分析,構(gòu)建主要重疊通路的串話網(wǎng)絡(luò),通過提取MDD和AD特異性蛋白質(zhì)相互作用子網(wǎng)絡(luò),確定與這兩種疾病相關(guān)的潛在風(fēng)險(xiǎn)基因。結(jié)果研究得到255個(gè)MDD易感基因和587個(gè)AD易感基因以及46個(gè)共享基因。通過分析確定了48條與免疫系統(tǒng)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)、內(nèi)分泌系統(tǒng)等顯著性共病通路。最后分析特異性子網(wǎng)絡(luò),預(yù)測(cè)出5個(gè)潛在風(fēng)險(xiǎn)基因:HSP90AA1、ELAVL1、CEBPB、HSP90AB1和YBX1。結(jié)論MDD與AD共病可能是多種分子和通路的功能異常引起的,且MDD易感基因可能在共病中發(fā)揮主要作用。
航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程雜志要求:
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