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利用InDel標記分析23份黃瓜種質的遺傳多樣性及核心種質資源篩選
關鍵詞：黃瓜 indel標記 核心種質 遺傳多樣性
摘要：為了研究不同來源黃瓜的親緣關系,篩選適宜作雜交親本的種質資源,基于黃瓜重測序開發的InDel標記,應用UPGMA進化樹聚類、主成分分析和群體遺傳結構分析3種方法分析了23份黃瓜種質的遺傳多樣性.結果表明:23份黃瓜種質的遺傳相似性系數為0.23-0.95,平均值為0.56,相似性系數低于0.6的有137對組合,占全部組合的54%,說明這些材料的遺傳多樣性較好.3種分析方法均將23份黃瓜種質分為三大類群:P1來源于亞洲,都屬于華南類型黃瓜;P2來源于歐洲和美國,包含歐洲類型長黃瓜、歐洲類型短黃瓜和2個美國加工型黃瓜;P3僅包含1個來源于廣東的品種,從表型上看屬于華南類型.P3親緣關系更接近P1,P1和P2之間遺傳差異明顯.利用InDel標記分析的結果,對核心種質最佳樣本量進行了預測,應用M策略將9份黃瓜種質確定為核心種質,包含了群體中幾乎所有的黃瓜類型,外形上有白刺、褐刺以及光滑型,這9份核心種質能夠很大范圍地覆蓋表型的變異.
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