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基于蠕形螨幾丁質合成酶基因的PCR-RFLP及序列進化分析
關鍵詞：蠕形螨 幾丁質合成酶
摘要：檢測33份來自上海地區的蠕形螨病犬毛囊樣品,其中能成功檢測出幾丁質合成酶基因16株,與參考序列比對結果顯示,16株樣本株出現6類序列,其中9株沒有發生突變,所有序列之間同源性在99.7%~99.9%,與其他參考株同源性在98.2%~100%之間。基于幾丁質合成酶基因序列的遺傳進化分析顯示,6類序列分為2組,其中第3類序列單獨為1組,第1、2、4、5、6類序列與日本、印度、陜西株為1個組。利用Cfr13I、BSPT1、HinfI、Eco131I對6類序列的擴增產物進行酶切,Cfr13I酶切可將第3類序列與其他序列區分開來,HinfI和BSPT1酶切可將第2類序列區分開來,而第1、4、5、6類序列由于序列之間同源性較高,除了突變的位點無法找到特異的酶切位點之外,即使存在酶切位點也無法準確地將不同序列區分開。由于Genbank關于蠕形螨的序列研究較少,已有序列之間同源性較高,可供RFLP序列分析的基因較少,本次試驗將PCR-RFLP分子標記技術成功應用于蠕形螨研究,蠕形螨幾丁質合成酶測序和酶切結果可用于蠕形螨的物種鑒定、親緣關系及進化研究。
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