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基于線粒體Cyt b基因的龍頭魚群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
關(guān)鍵詞：龍頭魚 cyt b基因 遺傳多樣性 遺傳分化
摘要：在我國(guó)黃海、東海和南海海岸帶上,選取青島、南通、舟山、三門、寧德、泉州和湛江共7個(gè)群體164尾龍頭魚(Harpadon nehereus)為研究對(duì)象,通過(guò)PCR擴(kuò)增共獲得長(zhǎng)度為1112 bp的線粒體DNA細(xì)胞色素b(Cyt b)基因序列,共檢測(cè)到32個(gè)變異位點(diǎn),其中單變異位點(diǎn)27個(gè),簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)1個(gè)。164條序列定義了29個(gè)單倍型,平均單倍型多樣性(Hd)和核苷酸多樣性(π)分別為0.3026±0.0479和0.000371±0.000379,其中泉州群體的單倍型多樣性和核苷酸多樣性均最低。分析比較了不同龍頭魚群體間遺傳變異情況,發(fā)現(xiàn)群體間平均遺傳距離為0.00035,遺傳分化指數(shù)FST值均小于0.05,群體間沒有發(fā)生明顯的遺傳分化。AMOVA分析結(jié)果顯示龍頭魚群體遺傳差異主要來(lái)源于群體內(nèi)個(gè)體間的變異。中性檢驗(yàn)的Tajima’s D和Fu’s Fs統(tǒng)計(jì)值均為負(fù)值且顯著偏離中性,核苷酸不配對(duì)分布圖呈現(xiàn)明顯的單峰分布,表明龍頭魚歷史上經(jīng)歷了群體擴(kuò)張事件,參考已知海洋魚類Cyt b基因2%每百萬(wàn)年的進(jìn)化速率,估算群體擴(kuò)張發(fā)生的時(shí)間大約在0.08—0.32百萬(wàn)年前的第四紀(jì)更新世中晚期。
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