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哺乳動物細胞色素P450酶中底物識別位點與功能的進化關系

王珺霞 畢杰 盧星宇 王振 李亦學 上海交通大學生命科學技術學院 上海200240 上海科技大學生命科學與技術學院 上海200031 中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所系統生物學重點實驗室 上海200031 上海生物信息技術研究中心 上海201203

關鍵詞:cyp酶 家族規模 活躍亞家族 底物識別位點 進化速率 

摘要:細胞色素P450(cytochromeP450,CYP)酶存在于所有哺乳動物中,它們從共同的祖先通過基因倍增進化而來,以一種“爆炸性”的趨勢形成了龐大的超家族。除代謝脂質等內源性物質外,部分CYP酶還在藥物等外源性物質的代謝方面起到重要作用。通過收集和注釋哺乳動物CYP酶的序列發現,家族規模發生顯著變化的七個活躍亞家族均屬于CYPl~4家族.相比之下,非CYPl~4家族的家族規模則基本保持穩定。基于二級結構的預測結果,六段底物識別位點(substrerecognitionsites,SRSs)的進化速率在CYPl~4家族中,特別是活躍的亞家族中,也顯著快于非CYPl~4家族。同時,SRSl~3的進化速率顯著快于SRS4~6,說明SRSl.3在更大程度上決定了CYP酶在進化過程中所獲得的新功能。

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