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利用高分化種內(nèi)和種間序列構(gòu)建單倍型中介網(wǎng)絡(luò)

康斌 程詩(shī)萌 閆靜靜 彭金彪 章樹(shù)業(yè) 上海市公共衛(wèi)生臨床中心 上海201508 復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院 上海200032

關(guān)鍵詞:單倍型網(wǎng)絡(luò) 中介網(wǎng)絡(luò) 群體遺傳 祖先序列 il37 

摘要:單倍型網(wǎng)絡(luò)是用于分析和顯示單倍型序列進(jìn)化關(guān)系的常用方法。中介網(wǎng)絡(luò)法常用于構(gòu)建單倍型網(wǎng)絡(luò),但該方法在利用序列差異較大的數(shù)據(jù)構(gòu)建單倍型網(wǎng)絡(luò)時(shí),會(huì)因長(zhǎng)支問(wèn)題導(dǎo)致算法可靠性下降。作者利用人.大猩猩祖先序列及人群IL37基因序列重建了代表人類共同祖先的中介序列。再將該序列與高分化人群DNA序列及外群序列一起構(gòu)建單倍型中介網(wǎng)絡(luò),有效解決了長(zhǎng)支問(wèn)題,提高了構(gòu)建單倍型中介網(wǎng)絡(luò)的可靠性,為解決同類問(wèn)題提供了一種簡(jiǎn)便有效的參考方法。

生物物理學(xué)報(bào)雜志要求:

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{2}所有來(lái)稿將按照本刊內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)的審稿程序規(guī)則審查稿件。

{3}中、英文摘要和關(guān)鍵詞。本刊所有論文均需有中、英文摘要和關(guān)鍵詞。中文摘要應(yīng)是濃縮論文的獨(dú)立短文,反映主要論點(diǎn)、創(chuàng)造性內(nèi)容,300字左右。

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