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環貴州喀斯特高原湖泊環境中的細菌多樣性
關鍵詞：環高原湖泊環境 細菌 純培養法 高通量測序
摘要：采用純培養方法,選用6種培養基對23份環貴州喀斯特高原湖泊環境土壤樣品中的細菌進行分離培養,經初步形態排重后共獲得83株細菌純培養物。菌株的16S rRNA基因序列信息顯示,這些菌株歸屬于3門12目15科19屬,優勢細菌類群為鏈霉菌屬(Streptomyces)、芽胞桿菌屬(Bacillus)、短芽胞桿菌屬(Brevibacillus)和北里孢菌屬(Kitasatospora)。同時采用高通量測序分析的方法評估了這些土壤樣品中的細菌群落結構特征。環境樣品中16S rRNA基因的V3~V4區序列分析顯示,從土壤樣品中檢測到分屬于17門36目74科130屬的細菌,涵蓋喀斯特高礦物質環境、鹽堿湖泊環境、森林土壤環境中存在的優勢菌群,其中變桿菌屬(Variibacter)、慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)以及嗜酸棲熱菌屬(Acidothermus)為優勢屬,體現出該生境中細菌群落結構的獨特性。綜合純培養和高通量測序分析結果,環貴州喀斯特高原湖泊環境樣品中細菌群落特征和環境之間存在著明顯相關性,其中蘊含著豐富的細菌資源,值得進一步挖掘。
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