購物車(0)
合作豬IFN-β基因編碼區(qū)克隆及生物信息學(xué)分析
關(guān)鍵詞：合作豬 克隆 生物信息學(xué)分析
摘要：克隆合作豬干擾素β(Interferon-beta,IFN-β)基因的編碼區(qū)序列(Coding region sequence,CDS),預(yù)測分析其結(jié)構(gòu)與功能。以NCBI/GenBank中豬IFN-β(登錄號:NM_001003923.1)的序列設(shè)計(jì)特異性引物,通過TA克隆技術(shù)得到合作豬IFN-β基因完整CDS區(qū),用生物信息學(xué)方法對其進(jìn)行分析。結(jié)果表明,合作豬IFN-β基因CDS區(qū)全長561 bp,編碼186個氨基酸,與參考序列相比,其編碼區(qū)的第177位點(diǎn)處的C突變?yōu)門,為同義突變。分子質(zhì)量約為21.95 ku,理論等電點(diǎn)(PI)為4.93,不穩(wěn)定系數(shù)為62.91,平均疏水性為-0.172;二級結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和無規(guī)則卷曲構(gòu)成,三級結(jié)構(gòu)與二級結(jié)構(gòu)預(yù)測基本一致。合作豬與巴馬豬、梅山豬和疣豬IFN-β核酸序列的相似性為99.47%、99.82%和98.75%。進(jìn)化樹結(jié)果表明,合作豬與梅山豬親緣關(guān)系最近。合作豬IFN-β屬于干擾素ab超家族,是不穩(wěn)定的酸性親水性蛋白,含有信號肽和跨膜區(qū)。
西北農(nóng)業(yè)學(xué)報雜志要求:
{1}如果來稿系基金項(xiàng)目資助的論文，請?jiān)谑醉撜撐念}名后以“宰”符號標(biāo)注，并鏈接至論文首頁地腳中表明基金項(xiàng)目的類別、名稱、項(xiàng)目編號。
{2}本刊秉持嚴(yán)謹(jǐn)治學(xué)之精神，歡迎獨(dú)著或合作的文章，反對一稿多投。
{3}文中使用的外文字母、符號，必須分清大小寫、正斜體，一些易混淆的字母請用鉛筆在其旁標(biāo)明;文中量和單位的使用參照最新國家標(biāo)準(zhǔn)GB3100－93，3101－93，3102－93。
{4}注釋：注釋主要用于對文章篇名、作者及文內(nèi)某一特定內(nèi)容作必要的解釋或說叫，序號用帶網(wǎng)目的阿拉伯?dāng)?shù)字標(biāo)注，放在當(dāng)頁頁腳，建議不超過5條。
{5}因匿名評審需要，正文部分不得出現(xiàn)與作者有關(guān)的任何信息。
注：因版權(quán)方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
