購物車(0)
鼠疫耶爾森菌CAF-1基因的生物信息學(xué)分析及抗原表位預(yù)測
關(guān)鍵詞：鼠疫耶爾森菌 抗原表位 生物信息學(xué)
摘要：目的探討鼠疫耶爾森菌CAF-1基因的組成結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能。方法運(yùn)用ProtScale,TMHMM Server,Signal P 3.0 Server,NetPhos3.0 Server,SOPMA,Swiss-mode和DNAStar等生物信息學(xué)軟件分析鼠疫耶爾森菌CAF-1基因的氨基酸序列組成、理化性質(zhì)、親疏水性、信號肽、磷酸化位點(diǎn)、糖基化位點(diǎn)、二、三級結(jié)構(gòu)和B、T細(xì)胞抗原表位等。結(jié)果 CAF-1是由170個氨基酸構(gòu)成的富含蘇氨酸的穩(wěn)定親水蛋白,相對分子質(zhì)量為17.7×10~3,理論等電點(diǎn)為4.83,不含跨膜區(qū)且磷酸化程度較高。二級結(jié)構(gòu)中β轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲為主要結(jié)構(gòu)原件,分別占41.18%和32.35%。同源建模顯示,GMQE和QMEAN評估分值分別為0.90和0.76。抗原表位預(yù)測顯示,該蛋白含有多個B細(xì)胞優(yōu)勢抗原表位和7個優(yōu)勢CTL表位。結(jié)論生物信息學(xué)預(yù)測CAF-1基因編碼蛋白為穩(wěn)定分泌蛋白和外膜蛋白,含有較多的B、T細(xì)胞抗原表位,具有較好的抗原性,可作為新型疫苗的潛在候選基因。
中國病原生物學(xué)雜志要求:
{1}作者的真實(shí)姓名、工作地址、學(xué)術(shù)簡歷和聯(lián)系方式。
{2}文章請勿一稿多投，審稿周期為一個月，自收到來稿一個月內(nèi)郵件回復(fù)作者，如果一個月內(nèi)未收到郵件回復(fù)，作者可自行處理稿件。
{3}圖、表和公式應(yīng)通篇順序編號，圖題、表題應(yīng)有中英文對照。表格應(yīng)采用三線表形式，內(nèi)容以中文表述。具體要求請?jiān)诒究W(wǎng)站下載《撰文書寫要求》。
{4}稿件注釋一律采用 “腳注”。注釋規(guī)則請參下附《注釋規(guī)范》，請投稿者嚴(yán)格遵循。
{5}前言：主要概述本文的立題依據(jù)、研究思路、實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)及國內(nèi)外現(xiàn)狀，并應(yīng)明確說明本文研究目的、創(chuàng)新性或特點(diǎn)等。
注：因版權(quán)方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
