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夏大豆重組自交系群體遺傳圖譜構(gòu)建及開(kāi)花期QTL分析
關(guān)鍵詞：大豆 開(kāi)花期 遺傳圖譜 qtl
摘要：【背景】開(kāi)花期是大豆重要的生育期性狀,不僅決定了大豆品種的適種范圍,而且對(duì)大豆的產(chǎn)量和品質(zhì)有重要影響。江淮地區(qū)是中國(guó)重要的大豆產(chǎn)區(qū),目前對(duì)該地區(qū)夏大豆開(kāi)花期性狀遺傳基礎(chǔ)研究相對(duì)較少?！灸康摹坷?個(gè)夏大豆材料雜交衍生的重組自交系群體對(duì)開(kāi)花期進(jìn)行QTL定位,為分子標(biāo)記輔助選擇育種和基因克隆提供依據(jù)?！痉椒ā恳钥曝S35(KF35)和南農(nóng)1138-2(NN1138-2)為親本,構(gòu)建了含91個(gè)家系(F2:8)的重組自交系群體(NJK3N-RIL),在6個(gè)環(huán)境下調(diào)查開(kāi)花期性狀數(shù)據(jù)。利用限制位點(diǎn)相關(guān)DNA測(cè)序(restriction-site associated DNA sequencing,RAD-seq)技術(shù)對(duì)群體親本及家系材料進(jìn)行SNP標(biāo)記分型,并利用窗口滑動(dòng)法進(jìn)行bin標(biāo)記劃分。利用bin標(biāo)記構(gòu)建該群體的遺傳圖譜,結(jié)合多年多點(diǎn)的表型數(shù)據(jù),使用QTL Network 2.2軟件中的基于混合線性模型的復(fù)合區(qū)間作圖法(mixed-model based composite interval mapping,MCIM)和Windows QTL Cartographer V2.5_011軟件中的復(fù)合區(qū)間作圖法(composite interval mapping,CIM)對(duì)開(kāi)花期性狀進(jìn)行QTL分析。【結(jié)果】在大豆全基因組范圍內(nèi)共獲得36778個(gè)高質(zhì)量SNP標(biāo)記,被劃分為1733個(gè)bin標(biāo)記。利用1733個(gè)bin標(biāo)記構(gòu)建了一張覆蓋大豆20條染色體遺傳圖譜,圖譜長(zhǎng)度為2362.4 cM,標(biāo)記間平均遺傳距離為1.4 cM。利用MCIM法共檢測(cè)到9個(gè)控制開(kāi)花期的加性QTL、2對(duì)上位性QTL和1個(gè)環(huán)境互作QTL,3種效應(yīng)累積貢獻(xiàn)率分別為63.9%、4.6%和2.1%。利用CIM法共檢測(cè)到10個(gè)控制開(kāi)花期的QTL,其中qFT-8-1、qFT-11-1、qFT-15-1、qFT-16-1能在3個(gè)及以上環(huán)境檢測(cè)到。綜合2種分析方法,共檢測(cè)到12個(gè)開(kāi)花期QTL,其中qFT-8-1、qFT-11-1、qFT-15-1、qFT-16-1、qFT-16-2、qFT-20-1和qFT-20-2等能夠被2種方法檢測(cè)到。同時(shí)qFT-5-1、qFT-8-1、qFT-8-2、qFT-13-1、qFT-15-1和qFT-20-2等是本研究新檢測(cè)到的開(kāi)花期QTL。【結(jié)論】夏大豆開(kāi)花期遺傳構(gòu)成復(fù)雜,但加性QTL效應(yīng)占絕對(duì)優(yōu)勢(shì),上?
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