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菌根共生網絡嵌套性判定的零模型選擇
關鍵詞：關系網絡 嵌套性 零模型 網絡非對稱性
摘要：零模型是判定網絡嵌套性的重要依據,菌根共生關系網絡經常出現高度非對稱性,該文通過探究矩陣非對稱變化對基于不同零模型構建方法的網絡嵌套性的影響,試圖為非對稱網絡零模型的選擇提供依據。結果表明:不同零模型保守性不同,增加限定條件減少零模型構建過程中的自由空間,高度限定條件易導致第II類錯誤。高度非對稱網絡會增加基于完全隨機(r00)零模型的矩陣溫度(NT)偏離、降低配對重疊度(NODF)偏離,標準化指數z-score值顯示網絡非對稱增加后有助于NT和NODF顯著性判定。行或列限定對非對稱網絡嵌套性判定的影響存在差異,列限定(c0)的網絡嵌套性判定對網絡非對稱性變化的響應規律與r00零模型的響應趨勢基本一致,具有更低的嵌套性偏離和標準差值。行限定(r0,包括行列限定(backtrack))零模型NT值和NT偏移隨矩陣非對稱性的變化保持穩定,較之c0零模型在高度非對稱網絡中呈現更低的NODF偏離值。選用完全隨機和限定零模型相結合的方法,有助于更加準確判斷非對稱網絡是否具有嵌套結構。高度非對稱網絡嵌套性判定中對行屬性特征比較敏感,不同非對稱性網絡間嵌套性水平相比較時選用r0零模型要優于r00和c0零模型。
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